L'istruzione costituisce la fase più impegnativa per I.S.I. e per l'utente.
Nella fase di avviamento l'Azienda deve investire le più ampie risorse umane per acquisire le conoscenze dell' Applicativo e adeguare la propria organizzazione.
Generalmente questa fase si articola in vari interventi, effettuati in tempi diversi, secondo un calendario, definito dall'Azienda, sulla base delle proprie esigenze. Pertanto, generalmente, si procede in fasi successive, ognuna dedicata ad un settore aziendale (contabilità, vendite, acquisti, magazzino, ordini, produzione, ecc.).

L'utente può sempre contare sui supporti conoscitivi forniti da I.S.I. e cioè:

Documentazione accessibile dal sito I.S.I., o dal proprio server
Help on Line, cioè il manuale operativo da richiamare per ogni funzione attiva in quel momento
Help Desk Telefonico, che consente l'assistenza telefonica con risposta nel minor tempo.
Help Desk via web, che consente di inoltrare, attraverso il sito I.S.I., i quesiti e di consultarne le risposte

I.S.I. è in grado, sulla base dell'esperienza acquisita in oltre 25 anni di attività di fornire la consulenza necessaria a guidare l'utente verso un'organizzazione efficiente nell'uso del pacchetto.

I.S.I. organizza inoltre Corsi e Meeting.
I corsi sono rivolti ai clienti ed alle aziende interessate all'approfondimento di temi specifici inerenti il Sistema Informativo Aziendale.
I meeting vengono organizzati in occasione di eventi che hanno rilevanza generale come novità legislative o novità tecnologiche.